Сезон 2005-2006 г. беше успешен за Надал. Той спечели 24 поредни мача. Победата във Откритото първенство на Франция и последвалите победи го поставиха на втория ред в рейтинга до края на сезона, въпреки контузията.
Върхът на кариерата му дойде през 2008 година. Спечелвайки Откритото първенство на Франция, Уимбълдън го постави на първия ред в класацията. Същата година Рафаел донесе златото на Олимпиадата в Пекин в сингъл.
2009 г. не беше твърде успешен за Надал поради контузия, но това не му попречи да се задържи във втория ред на рейтинга.
През 2010 г. Рафаел отново стана първата ракета в сингъл. Загуби този шампионат от Новак Джокович през 2011 година.
Друг връх в кариерата му беше 2013 г., когато Надал взе участие в 17 турнира, стигна до финалите за 14 и спечели 10 победи.
2016 година донесе на Надал вторият олимпийски златен медал в Рио де Жанейро в двойки. И през 2018 г. за 11-и път спечели Откритото първенство на Франция, което е рекорд. Той завърши сезона на първия ред в световната класация.
Има общо тринадесет титли от Ролан Гарос, което е абсолютен рекорд. Именно заради това е наричан Кралят на клея.
С отбора на Испания печели Купа Дейвис през 2004 г. Държи рекорда за най-много поредни победи при мъжете на една настилка – 81 победи на клей, постигнати между април 2005 и май 2007-а. Носител е на две награди на АТП – за новак на годината (2003) и тенисист с най-голям напредък (2005), както и Спортна награда Лауреус за новак на годината (2006). Рафаел влиза в топ 50 на света още на шестнадесет години, а две години по-късно вече е в подножието на върха, достигайки второто място.
Заради доминацията си на клей още в ранните години на кариерата си, Надал е определян от мнозина като най-добрия в историята на клей.
Победи-загуби 1068–220
Титли от Големия шлем 22
Титли от ATP 92
ОП на Австралия Шампион (2009, 2022)
Ролан Гарос Шампион (2005, 2006, 2007, 2008, 2010, 2011, 2012, 2013, 2014, 2017, 2018, 2019, 2020,2022)
Уимбълдън Шампион (2008, 2010)
ОП на САЩ Шампион (2010, 2013, 2017, 2019)